…limitaciones actuales para generar contenido accesible en objetos Flash:
Sistema Operativo. El usuario que desee tener acceso a la información de un objeto Flash a través de software de soporte de Accesibilidad (un lector de pantalla, por ejemplo) deberá contar con un sistema operativo Microsoft Windows. Limitar el acceso a la información en función de una única plataforma o entorno de usuario supone una barrera significativa para muchos individuos.

Navegador. La accesibilidad en los objetos Flash sólo está disponible a través del navegador Microsoft Internet Explorer. En otros navegadores, como es el caso de Mozilla Firefox, no hay soporte para la Accesibilidad de estos objetos. Esta dependencia del agente de usuario creado por Microsoft, viene dada por la tecnología Microsoft Active Accesibility (MSAA10) y su incompatibilidad con el motor actual de la mayoría de los navegadores. MSAA es la única vía que tiene Flash, por el momento, para ofrecer compatibilidad con lectores de pantalla y otras ayudas técnicas.

Simplemente, hacer un objeto Flash navegable y accesible mediante teclado en otros navegadores, requiere Javascript.
En otro fragmento de WebAIM lo explican:

Unless you are using version 7 of the Flash player in Internet Explorer for Windows, when Flash receives the focus within a web page, it maintains that focus. What this means is that once you click in or tab to a Flash movie, you cannot use the keyboard to navigate to other items on the page.

Por otra parte, aunque un Flash pueda ser navegado mediante teclado y “leído” por un lector de pantalla, el contenido Flash no tiene la carga semántica que puede tener un listado HTML, un encabezado. En el apartado “Usos inapropiados” del PDF que he citado antes lo explican:

Navegación e Interacción: Fundamentar la navegación e interacción de un sitio Web en tecnología Flash, puede llegar a suponer un problema. Pese a que el objeto Flash destinado a tal efecto contenga las alternativas textuales a cada enlace y elemento del menú, esta tecnología no aporta el sentido lógico que puede llegar a ofrecer actualmente un documento estructurado (a través de una lista de enumeración, por ejemplo).

Por otra parte, como se suele decir, las herramientas no son malas o buenas en sí, sino los usos que se hacen de ellas. En un post del 2009 de Smashing Magazine, 50 Beautiful Flash Websites se puede ver que casi nadie aplica técnicas para que cada página tenga su URL (SWF Address o similares), que muchos te plantan la típica intro en flash de esas que a nadie le gusta, te ponen música (otra cosa odiosa) o incluso te redimensionan la ventana del navegador al 100% para que el trabajo del diseñador pueda ser contemplado de forma correcta. El objetivo de todos estos sitios parece ser destacar por su diseño, cosa que a los usuarios normales no les importa tanto como nos gustaría.

Hace unos años “tenía sentido” hacer webs en Flash si se quería hacer algo vistoso, pero hoy, con los avances de CSS, javascript y los navegadores, no tiene ningún sentido, pienso.

Por otra parte Flash seguirá siendo por muuucho tiempo la mejor opción para insertar vídeo, animaciones y banners, pero la esencia de La Web, el hipertexto, se basa en HTML.

Como te comenta “Yo” navegar en webs hechas en flash al modo html es bastante habitual y nada complicado como comentas, yo lo hago en los sites flash que me piden y funciona perfectamente.

Lo de que no es indexable a día de hoy ya no ocurre, eso era antes, ahora sólo hay que seguir las buenas prácticas propuestas por Adobe en http://www.adobe.com/devnet/seo.html

Tampoco entiendo lo que dices de que los contenidos en flash son estáticos, en serio lo crees? Yo hago sites flash dinámicos sin parar desde hace años. Respecto del gestor de contenidos basta con hacerse uno o utilizar cualquiera de los más populares del mercado y utilizar flash como capa de representación.

Lo de que no se puede visualizar una película flash en el iPhone es algo que todo el mundo sabe, pero dale tiempo, de momento ya permiten hacer aplicaciones AIR para iPhone. Es claro que iPhone es una de las plataformas móviles más populares pero Android crece a un ritmo más rápido y permite flash sin problemas. Macromedia, fagocitada por Adobe, siempre se caracterizó por ofrecer soluciones rápidas a los desarrolladores y evolucionar con el mercado. No creo que Adobe deje escapar la oportunidad de estar presente en un gran porcentaje de dispositivos móviles en el futuro más inmediato.

Da la sensación de que estás especializado en webs html y no quieres que tus clientes te pidan cosas en flash, eso es del todo legítimo, pero si vas a escribir un post sobre lo mala que es la otra plataforma, la que parece que no dominas, sería bueno que te informaras con certeza de lo que escribes antes de lanzar este post totalmente errado.